追記ですが、MAGIC ENGINEで直前のセーブデータを拡張子を変換してプレイしてみたら、そちらでは問題の場面が進めたのでそこを進めてからセーブ後Ootakeにデータを戻したら再開は出来ました。
ですが、不具合には変わりないので可能なら修正お願いします。