私も非インストール版が欲しい派です。
理由は、評価後に消すのが楽だからです。
作者さんには申し訳ないですが、私はエミュレータ関連は
試用して満足いかなければ、即消します。

で、アーカイブであれば、デスクトップに展開して使ってみて
満足いかなければ、フォルダごとゴミ箱に捨てるだけです。
インストール版だと、わざわざコントロールパネルを開いて、
プログラムの追加と削除を開いてプログラムを探して・・・が必要になります。
それでゴミが残らないかも、確認しないとわかりません。
実際アンインストールしても「ootake」フォルダは残りますよね？
（BRAMも後々使う事がなければ残す意味がありません。ただのゴミです。
　それより後になって消していいのか分からないフォルダが残るのが問題です）

ですので、希望としてはexeをzipにリネームすれば、
アーカイブとしても開けるようにしていただければと思います。

＃個人的には、ROMイメージが自己解決のフリーのエミュレータで
　インストーラだけ整えても、あまり意味を成さない気はします。
　ROMイメージ付きで「インストールで即遊べます」とかであれば親切ですが・・・