自己解決しました。
ＦＣＤを選択するフォルダーの参照画面で、遊びたいソフトのフォルダを
一度クリックし、その後すぐに右クリックしてからＯＫを選ぶと、
Ootakeが落ちずに普通に遊べます。

なぜこのような挙動になってしまったのかは謎ですが、一応解決です。